Utenos rajone yra 186 vandens telkiniai, didesni nei 0,5 ha. Giliausias ir aukščiausias virš jūros lygio (165 m.) Lietuvoje – Tauragnų ežeras, garsėjantis vandens skaidrumu – Alaušo ežeras, užimantis net 10,73 kv.km plotą. Taip pat pažymėtinas vienas ilgiausių šalyje – Aiseto ežeras (16 km). Rajono pakraščiu vingiuoja Šventoji, kurios keli intakai surenka beveik visų per rajoną tekančių mažesnių ar didesnių upelių ir upokšnių vandenis. Didžiausias Šventosios intakas – Vyžuona, prasidedanti pietiniame rajono paribyje. Visi rajono vandenys užlieja net 5730 ha ir užima apie 4,7% rajono teritorijos. Žemiau pateikiame vandens maršrutų Utenos apskrityje aprašymus ir linkime puikių įspūdžių . Daugiau informacijos apie vandens maršrutus rasite internetinėje svetainėje:

http://www.upese.lt/index.php/upes-pagal-apskritis/utenos-apskrities-upes